En los últimos años las actividades mineras, industriales y urbanas han experimentado un desarrollo muy notorio, y ello ha traído consigo que, en muchos casos, se haya visto seriamente afectada la calidad del agua, sedimento y suelo de algunos sistemas acuáticos, por ejemplo, ríos y lagos. Esto es debido principalmente a la liberación de agua alterada de minas activas y abandonadas, e industria maquiladora con altos niveles de metales pesados como cobre, hierro, manganeso y zinc. El río Agua Prieta, Sonora, México, es transfronterizo (de USA hacia México) y se considera la principal fuente de abastecimiento de agua para las actividades industriales, agrícolas y ganaderas que se desarrollan a lo largo de su cauce en el Ejido Agua Prieta; además de ser un deteriorado hábitat para las especies naturales e inducidas que prevalecen en la región, y un componente importante de potencial influencia contaminante a los mantos freáticos, fuente única de abastecimiento para consumo humano en la ciudad de Agua Prieta, Sonora, México.